Na de Japanse landing in 1942 weet een verzetsgroep – samengesteld uit KNIL militairen en Molukkers – zich vanuit Manokwari terug te trekken in het binnenland en uit handen van de Japanners te blijven. De overlevenden van deze groep worden in de loop van 1944 door de geallieerden gevonden en opgepikt.
De Japanners bouwen langs de kust van de Vogelkop en op de eilanden voor de kust diverse vliegvelden. Door de ligging van deze vliegvelden ten opzichte van zowel de Noordelijke Molukken als de Geelvinkbaai vormen zij een bedreiging voor de bevoorrading van de Amerikaanse troepen die onderweg zijn via de Filipijnen richting Japan. De Amerikaanse luchtmacht voert in 1944 dan ook voortdurend bombardementen uit op de vliegvelden en landingstroepen weten deze ook stapsgewijs te veroveren. De verdere ontzetting van de Vogelkop vindt eerst in het najaar van 1945 plaats.
