In de Midden-Molukken is vooral het eiland Ambon van grote strategische betekenis voor de Japanners. Japan begint dan ook al op 19 januari 1942 met bombardementen op Ambon-stad. Omdat Australië Japanse aanvallen vreest als Ambon eenmaal is ingenomen, stuurt ze 1100 manschappen van de Gull Force naar Ambon. Maar de Japanse overmacht is te groot. Wanneer de Midden-Molukken in handen zijn, transporteren de Japanners duizenden geallieerde krijgsgevangenen naar Ambon, Haruku en Seram om vliegvelden en verdedigingswerken aan te leggen. De omstandigheden waaronder zij moeten leven en werken zijn zeer hard en de Japanners treden wreed op. Ook bij de Molukse inwoners wordt elke vorm van verzet met geweld de kop ingedrukt.